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No: | PDB id | Binding Data | Representative ligand | Formula | Smiles |
---|---|---|---|---|---|
The Class containing this family consists of a total of 4 families. | |||||
1 | 1Z6D | Ki = 4.6 mM | IMP | C10 H13 N4 O8 P | c1nc2c(n1[.... |
2 | 1O0H | Ki = 1.2 uM | ADP | C10 H15 N5 O10 P2 | c1nc(c2c(n.... |
3 | 1JVU | - | C2P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
4 | 3D7B | Ki = 203 uM | U4S | C13 H19 N3 O5 | C1CCN(C1)C.... |
5 | 3FL1 | - | CGP | C19 H25 N8 O10 P | c1nc2c(n1[.... |
6 | 6PVW | Ki = 0.48 uM | OZV | C10 H16 N5 O18 P5 | c1nc(c2c(n.... |
7 | 3D6Q | Ki = 172 uM | U3S | C14 H21 N3 O5 | C1CCN(CC1).... |
8 | 3JW1 | - | U5P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
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13 | 3LXO | Kd = 15 uM | T3P | C10 H15 N2 O8 P | CC1=CN(C(=.... |
14 | 1O0O | Ki = 8 uM | A2P | C10 H15 N5 O10 P2 | c1nc(c2c(n.... |
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21 | 1W4Q | Ki = 5.5 uM | UMF | C9 H12 F N2 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
22 | 6PVV | Ki = 1.4 uM | 5FA | C10 H18 N5 O19 P5 | c1nc(c2c(n.... |
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28 | 1RCN | - | DA DT DA DA | n/a | n/a |
29 | 6PVX | Ki = 0.068 uM | U5F | C9 H17 N2 O21 P5 | C1=CN(C(=O.... |
30 | 1RNM | - | C5P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
31 | 2W5K | Ki = 12 uM | NDP | C21 H30 N7 O17 P3 | c1nc(c2c(n.... |
32 | 2G8R | Ki = 103 uM | N3E | C15 H21 N3 O7 | C1CN(CCC1C.... |
33 | 1U1B | Kd = 16 nM | PAX | C20 H27 N7 O20 P4 | CC1=CN(C(=.... |
34 | 1QHC | Ki = 27 nM | PUA | C19 H27 N7 O20 P4 | c1nc(c2c(n.... |
35 | 3FL0 | - | CGP | C19 H25 N8 O10 P | c1nc2c(n1[.... |
36 | 4WYP | Kd = 440 uM | AMP | C10 H14 N5 O7 P | c1nc(c2c(n.... |
37 | 1O0M | Ki = 7.1 uM | U2P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
38 | 2QCA | - | DGP | C10 H14 N5 O7 P | c1nc2c(n1[.... |
39 | 3EV5 | - | TMO | C3 H9 N O | C[N+](C)(C.... |
40 | 4S18 | - | 1PT | C6 H14 N2 Pt | C1CC[C@@H].... |
41 | 1EOS | - | U2G | C19 H24 N7 O13 P | c1nc2c(n1[.... |
42 | 4RTE | - | CPT | Cl2 H6 N2 Pt | [NH3][Pt](.... |
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44 | 1W4O | Ki = 3 uM | UA3 | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
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47 | 6YO1 | - | UVC | C9 H12 N2 O9 V | C1=CN(C(=O.... |
48 | 1W4P | Ki = 18 uM | UM3 | C9 H13 N2 O8 P | C1[C@@H]([.... |
49 | 1AFL | Ki = 520 nM | ATR | C10 H16 N5 O13 P3 | c1nc(c2c(n.... |
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51 | 3RID | - | CGP | C19 H25 N8 O10 P | c1nc2c(n1[.... |
52 | 1RPG | - | CPA | C19 H25 N8 O9 P | c1nc(c2c(n.... |
53 | 1WBU | - | WBU | C4 H5 N3 O2 | C1=C(C(=O).... |
54 | 6QE9 | - | J9H | C17 H18 N3 Pt | Cc1ccc2ccc.... |
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56 | 1JN4 | Ki = 11.3 uM | 139 | C19 H25 N7 O14 P2 | c1nc(c2c(n.... |
57 | 1O0N | Ki = 82 uM | U3P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
58 | 1AFK | Ki = 240 nM | PAP | C10 H16 N5 O13 P3 | c1nc(c2c(n.... |
59 | 2XOI | Ki = 0.00046 M | SFB | C20 H28 N8 O11 S | c1nc(c2c(n.... |
60 | 1EOW | - | U2G | C19 H24 N7 O13 P | c1nc2c(n1[.... |
61 | 5OGH | - | C3P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
62 | 5NA9 | - | QPT | C6 H12 N2 O4 Pt | C1CC2(C1)C.... |
63 | 1F0V | - | DC DG | n/a | n/a |
64 | 2W5L | Ki = 63 uM | NAP | C21 H28 N7 O17 P3 | c1cc(c[n+].... |
65 | 1RUV | - | UVC | C9 H12 N2 O9 V | C1=CN(C(=O.... |
66 | 1Z6S | Ki = 46 uM | AMP | C10 H14 N5 O7 P | c1nc(c2c(n.... |
67 | 4G90 | Ki = 30.8 uM | 0G0 | C12 H14 F N5 O6 | c1c(nnn1[C.... |
68 | 6F60 | - | DVW | C27 H31 N7 O5 Pt | CC1=CC=C2C.... |
69 | 2W5G | Ki = 0.86 uM | ATP | C10 H16 N5 O13 P3 | c1nc(c2c(n.... |
70 | 3D8Z | Ki = 423 uM | TXS | C14 H21 N3 O4 | CC1=CN(C(=.... |
71 | 5JLG | - | RU | Ru | [Ru+3] |
72 | 11BA | - | UPA | C19 H24 N7 O12 P | c1nc(c2c(n.... |
73 | 1TQ9 | - | CPA | C19 H25 N8 O9 P | c1nc(c2c(n.... |
74 | 3DJO | Ki = 40.8 uM | U2P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
75 | 1N3Z | - | U3P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
76 | 3DJV | Ki = 27.9 uM | C3P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
77 | 1R5C | - | CPA | C19 H25 N8 O9 P | c1nc(c2c(n.... |
78 | 3DJQ | Ki = 1046.4 uM | UDP | C9 H14 N2 O12 P2 | C1=CN(C(=O.... |
79 | 3DJP | Ki = 63.2 uM | UA3 | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
80 | 3DJX | Ki = 1557.9 uM | C5P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
81 | 11BG | - | U2G | C19 H24 N7 O13 P | c1nc2c(n1[.... |
No: | PDB id | Binding Data | Representative ligand | Formula | Smiles |
---|---|---|---|---|---|
The Class containing this family consists of a total of 4 families. | |||||
1 | 1Z6D | Ki = 4.6 mM | IMP | C10 H13 N4 O8 P | c1nc2c(n1[.... |
2 | 1O0H | Ki = 1.2 uM | ADP | C10 H15 N5 O10 P2 | c1nc(c2c(n.... |
3 | 1JVU | - | C2P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
4 | 3D7B | Ki = 203 uM | U4S | C13 H19 N3 O5 | C1CCN(C1)C.... |
5 | 3FL1 | - | CGP | C19 H25 N8 O10 P | c1nc2c(n1[.... |
6 | 6PVW | Ki = 0.48 uM | OZV | C10 H16 N5 O18 P5 | c1nc(c2c(n.... |
7 | 3D6Q | Ki = 172 uM | U3S | C14 H21 N3 O5 | C1CCN(CC1).... |
8 | 3JW1 | - | U5P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
9 | 3EV6 | - | RSF | C6 H10 O3 | C1CO[C@H]2.... |
10 | 2W5I | Ki = 0.86 uM | ATP | C10 H16 N5 O13 P3 | c1nc(c2c(n.... |
11 | 3D8Y | Ki = 396 uM | T3S | C15 H23 N3 O4 | CC1=CN(C(=.... |
12 | 3D6O | Ki = 77 uM | U1S | C17 H25 N3 O7 | CCOC(=O)C1.... |
13 | 3LXO | Kd = 15 uM | T3P | C10 H15 N2 O8 P | CC1=CN(C(=.... |
14 | 1O0O | Ki = 8 uM | A2P | C10 H15 N5 O10 P2 | c1nc(c2c(n.... |
15 | 1RPF | - | C3P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
16 | 3D6P | Ki = 179 uM | U2S | C13 H19 N3 O6 | C1COCCN1C[.... |
17 | 4G8V | Ki = 1.6 uM | 0EY | C12 H15 N5 O6 | c1c(nnn1[C.... |
18 | 1RNC | - | 5GP | C10 H14 N5 O8 P | c1nc2c(n1[.... |
19 | 4WYZ | Kd = 50 uM | U3P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
20 | 1ROB | - | C2P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
21 | 1W4Q | Ki = 5.5 uM | UMF | C9 H12 F N2 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
22 | 6PVV | Ki = 1.4 uM | 5FA | C10 H18 N5 O19 P5 | c1nc(c2c(n.... |
23 | 1O0F | Ki = 5 uM | A3P | C10 H15 N5 O10 P2 | c1nc(c2c(n.... |
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28 | 1RCN | - | DA DT DA DA | n/a | n/a |
29 | 6PVX | Ki = 0.068 uM | U5F | C9 H17 N2 O21 P5 | C1=CN(C(=O.... |
30 | 1RNM | - | C5P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
31 | 2W5K | Ki = 12 uM | NDP | C21 H30 N7 O17 P3 | c1nc(c2c(n.... |
32 | 2G8R | Ki = 103 uM | N3E | C15 H21 N3 O7 | C1CN(CCC1C.... |
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34 | 1QHC | Ki = 27 nM | PUA | C19 H27 N7 O20 P4 | c1nc(c2c(n.... |
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37 | 1O0M | Ki = 7.1 uM | U2P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
38 | 2QCA | - | DGP | C10 H14 N5 O7 P | c1nc2c(n1[.... |
39 | 3EV5 | - | TMO | C3 H9 N O | C[N+](C)(C.... |
40 | 4S18 | - | 1PT | C6 H14 N2 Pt | C1CC[C@@H].... |
41 | 1EOS | - | U2G | C19 H24 N7 O13 P | c1nc2c(n1[.... |
42 | 4RTE | - | CPT | Cl2 H6 N2 Pt | [NH3][Pt](.... |
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44 | 1W4O | Ki = 3 uM | UA3 | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
45 | 1RNN | - | C5P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
46 | 2XOG | Ki = 0.37 mM | SFB | C20 H28 N8 O11 S | c1nc(c2c(n.... |
47 | 6YO1 | - | UVC | C9 H12 N2 O9 V | C1=CN(C(=O.... |
48 | 1W4P | Ki = 18 uM | UM3 | C9 H13 N2 O8 P | C1[C@@H]([.... |
49 | 1AFL | Ki = 520 nM | ATR | C10 H16 N5 O13 P3 | c1nc(c2c(n.... |
50 | 3EV3 | - | TBU | C4 H10 O | CC(C)(C)O |
51 | 3RID | - | CGP | C19 H25 N8 O10 P | c1nc2c(n1[.... |
52 | 1RPG | - | CPA | C19 H25 N8 O9 P | c1nc(c2c(n.... |
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54 | 6QE9 | - | J9H | C17 H18 N3 Pt | Cc1ccc2ccc.... |
55 | 4G8Y | Ki = 25.8 uM | 0FT | C13 H17 N5 O6 | CC1=CN(C(=.... |
56 | 1JN4 | Ki = 11.3 uM | 139 | C19 H25 N7 O14 P2 | c1nc(c2c(n.... |
57 | 1O0N | Ki = 82 uM | U3P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
58 | 1AFK | Ki = 240 nM | PAP | C10 H16 N5 O13 P3 | c1nc(c2c(n.... |
59 | 2XOI | Ki = 0.00046 M | SFB | C20 H28 N8 O11 S | c1nc(c2c(n.... |
60 | 1EOW | - | U2G | C19 H24 N7 O13 P | c1nc2c(n1[.... |
61 | 5OGH | - | C3P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
62 | 5NA9 | - | QPT | C6 H12 N2 O4 Pt | C1CC2(C1)C.... |
63 | 1F0V | - | DC DG | n/a | n/a |
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66 | 1Z6S | Ki = 46 uM | AMP | C10 H14 N5 O7 P | c1nc(c2c(n.... |
67 | 4G90 | Ki = 30.8 uM | 0G0 | C12 H14 F N5 O6 | c1c(nnn1[C.... |
68 | 6F60 | - | DVW | C27 H31 N7 O5 Pt | CC1=CC=C2C.... |
69 | 2W5G | Ki = 0.86 uM | ATP | C10 H16 N5 O13 P3 | c1nc(c2c(n.... |
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71 | 5JLG | - | RU | Ru | [Ru+3] |
72 | 11BA | - | UPA | C19 H24 N7 O12 P | c1nc(c2c(n.... |
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74 | 3DJO | Ki = 40.8 uM | U2P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
75 | 1N3Z | - | U3P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
76 | 3DJV | Ki = 27.9 uM | C3P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
77 | 1R5C | - | CPA | C19 H25 N8 O9 P | c1nc(c2c(n.... |
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79 | 3DJP | Ki = 63.2 uM | UA3 | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
80 | 3DJX | Ki = 1557.9 uM | C5P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
81 | 11BG | - | U2G | C19 H24 N7 O13 P | c1nc2c(n1[.... |
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83 | 2RNF | - | UM3 | C9 H13 N2 O8 P | C1[C@@H]([.... |
No: | Ligand | ECFP6 Tc | MDL keys Tc |
---|---|---|---|
1 | U2G | 1 | 1 |
2 | CG2 | 0.8 | 1 |
3 | GPG | 0.707547 | 0.95 |
4 | UPA | 0.686957 | 0.925 |
5 | GDP | 0.634615 | 0.936709 |
6 | GNH | 0.628571 | 0.925 |
7 | GP3 | 0.625 | 0.9375 |
8 | GSP | 0.62037 | 0.891566 |
9 | 5GP | 0.617647 | 0.924051 |
10 | G | 0.617647 | 0.924051 |
11 | GTP | 0.616822 | 0.936709 |
12 | GKE | 0.608696 | 0.95 |
13 | GDC | 0.608696 | 0.95 |
14 | GDD | 0.608696 | 0.95 |
15 | UCG | 0.607692 | 0.95 |
16 | GMV | 0.601852 | 0.91358 |
17 | G1R | 0.59633 | 0.925 |
18 | GCP | 0.59633 | 0.91358 |
19 | G2R | 0.59292 | 0.902439 |
20 | GNP | 0.590909 | 0.91358 |
21 | 9GM | 0.590909 | 0.91358 |
22 | GAV | 0.580357 | 0.902439 |
23 | GKD | 0.575 | 0.95 |
24 | GP2 | 0.574074 | 0.902439 |
25 | 6CK | 0.571429 | 0.903614 |
26 | GPC | 0.565891 | 0.939759 |
27 | GFB | 0.563025 | 0.925926 |
28 | GDR | 0.563025 | 0.925926 |
29 | G2P | 0.5625 | 0.902439 |
30 | JB2 | 0.561983 | 0.925926 |
31 | GDP BEF | 0.553571 | 0.878049 |
32 | YGP | 0.546219 | 0.915663 |
33 | G3A | 0.545455 | 0.9375 |
34 | GDX | 0.544715 | 0.9375 |
35 | ALF 5GP | 0.544643 | 0.837209 |
36 | Y9Z | 0.541667 | 0.872093 |
37 | G5P | 0.540984 | 0.9375 |
38 | GMP | 0.54 | 0.848101 |
39 | GTG | 0.53719 | 0.903614 |
40 | JB3 | 0.535433 | 0.914634 |
41 | GTP MG | 0.535088 | 0.9 |
42 | GPD | 0.532258 | 0.892857 |
43 | G4P | 0.525862 | 0.924051 |
44 | 0O2 | 0.521008 | 0.924051 |
45 | FEG | 0.51938 | 0.850575 |
46 | G C | 0.519084 | 0.9625 |
47 | TPG | 0.518248 | 0.855556 |
48 | GDP AF3 | 0.516949 | 0.837209 |
49 | GDP ALF | 0.516949 | 0.837209 |
50 | ZGP | 0.515385 | 0.840909 |
51 | 2GP | 0.509259 | 0.924051 |
52 | 3GP | 0.509259 | 0.911392 |
53 | G3D | 0.508621 | 0.924051 |
54 | NGD | 0.507692 | 0.925926 |
55 | 2MD | 0.507576 | 0.905882 |
56 | CAG | 0.507463 | 0.852273 |
57 | KB7 | 0.5 | 0.8 |
58 | FE9 | 0.49635 | 0.791667 |
59 | MGD | 0.496296 | 0.905882 |
60 | OMC OMU OMG OMG U | 0.493243 | 0.904762 |
61 | UPU | 0.482143 | 0.822785 |
62 | 4TC | 0.480916 | 0.890244 |
63 | U2P | 0.480392 | 0.810127 |
64 | GDP 7MG | 0.480315 | 0.879518 |
65 | APU | 0.477273 | 0.9125 |
66 | UP5 | 0.476923 | 0.9125 |
67 | PGD | 0.471429 | 0.915663 |
68 | MD1 | 0.471429 | 0.905882 |
69 | DBG | 0.464789 | 0.914634 |
70 | P2G | 0.460177 | 0.851852 |
71 | KBD | 0.459677 | 0.821429 |
72 | G 5MC C U | 0.459627 | 0.927711 |
73 | G4M | 0.453333 | 0.873563 |
74 | GPX | 0.447154 | 0.8875 |
75 | G1G | 0.446809 | 0.892857 |
76 | KBJ | 0.445312 | 0.793103 |
77 | I2C FE2 CMO CMO | 0.443662 | 0.824176 |
78 | 139 | 0.437956 | 0.891566 |
79 | 3PD UM3 | 0.437956 | 0.903614 |
80 | CGP | 0.434783 | 0.927711 |
81 | PUP | 0.434426 | 0.780488 |
82 | PGD O | 0.431507 | 0.865169 |
83 | GH3 | 0.430894 | 0.9125 |
84 | DGI | 0.428571 | 0.86747 |
85 | P1G | 0.42735 | 0.841463 |
86 | DGT | 0.42623 | 0.86747 |
87 | G1R G1R | 0.424658 | 0.891566 |
88 | IDP | 0.423729 | 0.911392 |
89 | BGO | 0.42029 | 0.891566 |
90 | DG | 0.413793 | 0.855422 |
91 | DGP | 0.413793 | 0.855422 |
92 | UDP | 0.410714 | 0.822785 |
93 | AKW | 0.410072 | 0.860465 |
94 | M7G A2M G | 0.408284 | 0.824176 |
95 | IMP | 0.405172 | 0.898734 |
96 | QBQ | 0.401639 | 0.924051 |
97 | GGM | 0.401408 | 0.870588 |
98 | CSV | 0.4 | 0.841463 |
99 | UTP | 0.4 | 0.822785 |
100 | CSQ | 0.4 | 0.841463 |
No: | Ligand | Similarity coefficient |
---|
This union binding pocket(no: 1) in the query (biounit: 1u1b.bio2) has 86 residues | |||
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No: | Leader PDB | Ligand | Sequence Similarity |
This union binding pocket(no: 2) in the query (biounit: 1u1b.bio1) has 79 residues | |||
---|---|---|---|
No: | Leader PDB | Ligand | Sequence Similarity |
1 | 2GMK | AMP | 40.3846 |