- Navigate
- Expand All | Collapse All
- Receptor | Ligand | View in 3D
- Family: 90% | 70% | 50% | site
- External Links
- |
- Download
- Structure Biounit | Ligand Information
- PDB : .ZIP | .CSV
- Family 90% : .ZIP | .CSV
- Class : .ZIP | .CSV
No: | PDB id | Binding Data | Representative ligand | Formula | Smiles |
---|---|---|---|---|---|
The Class containing this family consists of a total of 5 families. | |||||
1 | 1YXW | - | TYR GLU TRP | n/a | n/a |
2 | 3HN1 | - | SIA SIA | n/a | n/a |
3 | 1DIW | - | GAL | C6 H12 O6 | C([C@@H]1[.... |
4 | 5TPC | Kd = 1 mM | GAL SIA NGA GAL SIA | n/a | n/a |
5 | 2VU9 | - | BGC GAL SIA NGA GAL SIA | n/a | n/a |
6 | 3R4S | - | SLB | C11 H19 N O9 | CC(=O)N[C@.... |
7 | 3OBT | - | SLB | C11 H19 N O9 | CC(=O)N[C@.... |
8 | 3RSJ | - | GAL SIA NGA GAL SIA | n/a | n/a |
No: | Ligand | ECFP6 Tc | MDL keys Tc |
---|---|---|---|
1 | GAL NGA GAL SIA | 1 | 1 |
2 | BGC GAL SIA NGA GAL SIA | 0.895238 | 1 |
3 | BGC GAL GLA NGA GAL SIA | 0.886792 | 1 |
4 | GAL NGA GAL SIA SIA | 0.87156 | 0.981132 |
5 | GAL SIA NGA GAL SIA | 0.826923 | 1 |
6 | BGC GAL SIA NGA GAL | 0.818182 | 1 |
7 | BGC GAL SIA SIA | 0.781818 | 0.981132 |
8 | GLC GAL NGC | 0.769231 | 0.924528 |
9 | A2G GAL SIA | 0.757282 | 1 |
10 | NAG GAL SIA | 0.75 | 1 |
11 | SIA GAL NGA GAL | 0.743119 | 1 |
12 | GAL SIA NGA GAL SIA SIA | 0.735043 | 0.981132 |
13 | BGC GAL SIA NGA GAL FUC | 0.715447 | 1 |
14 | BGC GAL SIA NAG | 0.710526 | 1 |
15 | NAG GAL SIA SIA | 0.690265 | 0.981132 |
16 | NAG GAL NGC | 0.6875 | 0.962264 |
17 | NGA GAL SIA | 0.684685 | 0.980769 |
18 | GAL SIA NGA GAL | 0.681416 | 0.981132 |
19 | GAL NAG FUC GAL SIA | 0.666667 | 1 |
20 | NAG FUC GAL SIA | 0.65812 | 1 |
21 | NGS GAL SIA | 0.655172 | 0.787879 |
22 | BGC GAL SIA | 0.648649 | 0.943396 |
23 | NDG GAL SIA SIA | 0.646552 | 0.945455 |
24 | MAG FUC GAL SIA | 0.644068 | 0.962264 |
25 | BGC GAL SIA NGA SIA | 0.632812 | 0.981132 |
26 | BGC GAL NAG GAL SIA | 0.629032 | 0.981132 |
27 | NGA POL GAL NGC AZI | 0.626016 | 0.784615 |
28 | GAL SIA NGA | 0.619469 | 1 |
29 | BGC CEQ GAL SLB NGA GAL SIA SIA | 0.615942 | 0.83871 |
30 | Z3Q GAL 5N6 | 0.609756 | 0.83871 |
31 | NAG 2FG SIA | 0.594828 | 0.928571 |
32 | 2FG SIA | 0.59434 | 0.892857 |
33 | NGS FUC GLA SIA | 0.59375 | 0.787879 |
34 | NAG GAL PKM | 0.59322 | 0.981132 |
35 | GAL 5N6 | 0.587156 | 0.962264 |
36 | GAL NAG GAL SIA | 0.583333 | 0.981132 |
37 | GAL SIA SIA | 0.578947 | 0.981132 |
38 | MBG NGC | 0.568807 | 0.907407 |
39 | BGC 16C GAL SIA | 0.553191 | 0.83871 |
40 | NAG GAL NAG GAL SIA | 0.546154 | 0.981132 |
41 | BGC 18C GAL SIA | 0.534722 | 0.83871 |
42 | BGC 18C GAL SIA NGA GAL | 0.525641 | 0.83871 |
43 | BGC GAL NAG GAL | 0.518868 | 0.865385 |
44 | BGC GAL NGA GAL | 0.514286 | 0.865385 |
45 | BGC GAL GLA NGA GAL | 0.5 | 0.865385 |
46 | NAG GAL 5N6 | 0.492188 | 0.962963 |
47 | GAL SIA | 0.468468 | 0.924528 |
48 | SIA CMO | 0.465347 | 0.87037 |
49 | CEQ BGC NGA GAL SIA SIA | 0.460526 | 0.8 |
50 | BGC GAL NAG GAL FUC | 0.45 | 0.884615 |
51 | BGC GAL NAG | 0.445455 | 0.865385 |
52 | GLC GAL NAG GAL FUC GLA | 0.432 | 0.884615 |
53 | BGC GAL GLA NGA | 0.426087 | 0.865385 |
54 | NAG SIA | 0.420168 | 0.910714 |
55 | GAL 1GN BGC ACY GAL 1GN BGC ACY GAL 6PZ | 0.418919 | 0.945455 |
56 | GLC GAL NAG GAL FUC A2G | 0.415385 | 0.942308 |
57 | C4W NAG FUC BMA MAN NAG GAL SIA | 0.415094 | 0.852459 |
58 | MAN NAG PO4 NGA PO4 | 0.413793 | 0.87931 |
59 | MNA | 0.413462 | 0.851852 |
60 | SIA SIA | 0.410256 | 0.962264 |
61 | BGC GAL NGA | 0.409091 | 0.865385 |
62 | C4W NAG FUC BMA MAN MAN NAG GAL SIA NAG | 0.408284 | 0.852459 |
63 | SLB SIA SIA SIA SIA | 0.40678 | 0.962264 |
64 | SLB SIA SIA | 0.40678 | 0.962264 |
65 | SIA SIA SIA SIA SIA SIA SIA | 0.40678 | 0.962264 |
66 | SLB SIA SIA SIA | 0.40678 | 0.962264 |
67 | SIA SIA SIA | 0.401639 | 0.962264 |
68 | BGC GAL NAG GAL FUC FUC | 0.401575 | 0.903846 |
No: | Ligand | ECFP6 Tc | MDL keys Tc |
---|---|---|---|
1 | GAL SIA NGA GAL SIA | 1 | 1 |
2 | SIA GAL NGA GAL | 0.881188 | 1 |
3 | GAL SIA NGA GAL SIA SIA | 0.87963 | 0.981132 |
4 | BGC GAL SIA NGA GAL SIA | 0.842593 | 1 |
5 | GAL NGA GAL SIA | 0.826923 | 1 |
6 | BGC GAL GLA NGA GAL SIA | 0.769912 | 1 |
7 | BGC GAL SIA NGA GAL | 0.769912 | 1 |
8 | GAL SIA NGA | 0.759615 | 1 |
9 | A2G GAL SIA | 0.757282 | 1 |
10 | GAL NGA GAL SIA SIA | 0.74359 | 0.981132 |
11 | NAG GAL SIA | 0.716981 | 1 |
12 | GAL SIA NGA GAL | 0.696429 | 0.981132 |
13 | GAL NAG FUC GAL SIA | 0.694915 | 1 |
14 | NAG GAL SIA SIA | 0.690265 | 0.981132 |
15 | NAG FUC GAL SIA | 0.686957 | 1 |
16 | NGA GAL SIA | 0.684685 | 0.980769 |
17 | BGC GAL SIA SIA | 0.675214 | 0.981132 |
18 | BGC GAL SIA NGA GAL FUC | 0.674603 | 1 |
19 | BGC GAL SIA NAG | 0.666667 | 1 |
20 | BGC CEQ GAL SLB NGA GAL SIA SIA | 0.664179 | 0.83871 |
21 | MAG FUC GAL SIA | 0.65812 | 0.962264 |
22 | NAG GAL NGC | 0.657895 | 0.962264 |
23 | NDG GAL SIA SIA | 0.646552 | 0.945455 |
24 | GLC GAL NGC | 0.642857 | 0.924528 |
25 | NGS GAL SIA | 0.641026 | 0.787879 |
26 | NGA POL GAL NGC AZI | 0.626016 | 0.784615 |
27 | BGC GAL SIA NGA SIA | 0.607692 | 0.981132 |
28 | GAL SIA SIA | 0.607143 | 0.981132 |
29 | NGS FUC GLA SIA | 0.606299 | 0.787879 |
30 | GAL 5N6 | 0.601852 | 0.962264 |
31 | Z3Q GAL 5N6 | 0.596774 | 0.83871 |
32 | NAG 2FG SIA | 0.594828 | 0.928571 |
33 | 2FG SIA | 0.59434 | 0.892857 |
34 | GAL NAG GAL SIA | 0.583333 | 0.981132 |
35 | NAG GAL PKM | 0.579832 | 0.981132 |
36 | MBG NGC | 0.568807 | 0.907407 |
37 | BGC 18C GAL SIA NGA GAL | 0.545455 | 0.83871 |
38 | BGC GAL SIA | 0.537815 | 0.943396 |
39 | BGC GAL NAG GAL SIA | 0.530303 | 0.981132 |
40 | BGC 16C GAL SIA | 0.520833 | 0.83871 |
41 | BGC 18C GAL SIA | 0.513699 | 0.83871 |
42 | NAG GAL NAG GAL SIA | 0.511278 | 0.981132 |
43 | CEQ BGC NGA GAL SIA SIA | 0.489933 | 0.8 |
44 | GAL SIA | 0.468468 | 0.924528 |
45 | SIA CMO | 0.465347 | 0.87037 |
46 | NAG GAL 5N6 | 0.458015 | 0.962963 |
47 | GAL 1GN BGC ACY GAL 1GN BGC ACY GAL 6PZ | 0.438356 | 0.945455 |
48 | SIA SIA | 0.422414 | 0.962264 |
49 | NAG SIA | 0.420168 | 0.910714 |
50 | SLB SIA SIA SIA | 0.418803 | 0.962264 |
51 | SIA SIA SIA SIA SIA SIA SIA | 0.418803 | 0.962264 |
52 | SLB SIA SIA SIA SIA | 0.418803 | 0.962264 |
53 | SLB SIA SIA | 0.418803 | 0.962264 |
54 | MNA | 0.413462 | 0.851852 |
55 | SIA SIA SIA | 0.413223 | 0.962264 |
56 | BGC GAL NAG GAL | 0.412281 | 0.865385 |
57 | BGC GAL GLA NGA GAL | 0.410256 | 0.865385 |
58 | BGC GAL NGA GAL | 0.40708 | 0.865385 |
No: | Ligand | ECFP6 Tc | MDL keys Tc |
---|---|---|---|
1 | NGA GAL SIA | 1 | 1 |
2 | A2G GAL SIA | 0.816327 | 0.980769 |
3 | NAG GAL SIA SIA | 0.740741 | 0.962264 |
4 | NAG GAL SIA | 0.721154 | 0.980769 |
5 | GAL NGA GAL SIA | 0.684685 | 0.980769 |
6 | GAL SIA NGA GAL SIA | 0.684685 | 0.980769 |
7 | NAG FUC GAL SIA | 0.675439 | 0.980769 |
8 | NAG GAL NGC | 0.660714 | 0.943396 |
9 | NGS GAL SIA | 0.657895 | 0.772727 |
10 | NAG 2FG SIA | 0.63964 | 0.910714 |
11 | BGC GAL SIA SIA | 0.635593 | 0.962264 |
12 | NDG GAL SIA SIA | 0.634783 | 0.927273 |
13 | BGC GAL SIA NGA GAL SIA | 0.633333 | 0.980769 |
14 | BGC GAL GLA NGA GAL SIA | 0.628099 | 0.980769 |
15 | GAL SIA NGA GAL SIA SIA | 0.626016 | 0.962264 |
16 | GAL NGA GAL SIA SIA | 0.620968 | 0.962264 |
17 | NGS FUC GLA SIA | 0.620968 | 0.772727 |
18 | MAG FUC GAL SIA | 0.618644 | 0.980769 |
19 | GLC GAL NGC | 0.60177 | 0.90566 |
20 | GAL NAG FUC GAL SIA | 0.601626 | 0.980769 |
21 | NGA POL GAL NGC AZI | 0.601626 | 0.769231 |
22 | SIA GAL NGA GAL | 0.598291 | 0.980769 |
23 | 2FG SIA | 0.596154 | 0.875 |
24 | GAL 5N6 | 0.588785 | 0.943396 |
25 | Z3Q GAL 5N6 | 0.585366 | 0.822581 |
26 | MBG NGC | 0.584906 | 0.924528 |
27 | GAL SIA NGA GAL | 0.584746 | 0.962264 |
28 | GAL SIA SIA | 0.580357 | 0.962264 |
29 | BGC GAL SIA NGA GAL | 0.576 | 0.980769 |
30 | NAG GAL PKM | 0.567797 | 0.962264 |
31 | BGC 16C GAL SIA | 0.553957 | 0.822581 |
32 | GAL SIA NGA | 0.551724 | 0.980769 |
33 | BGC 18C GAL SIA | 0.546099 | 0.822581 |
34 | BGC GAL SIA NAG | 0.536 | 0.980769 |
35 | BGC CEQ GAL SLB NGA GAL SIA SIA | 0.527778 | 0.822581 |
36 | GAL NAG GAL SIA | 0.508065 | 0.962264 |
37 | BGC GAL SIA NGA GAL FUC | 0.507246 | 0.980769 |
38 | BGC GAL SIA NGA SIA | 0.492754 | 0.962264 |
39 | NAG GAL NAG GAL SIA | 0.488722 | 0.962264 |
40 | BGC GAL SIA | 0.487603 | 0.924528 |
41 | SIA CMO | 0.479592 | 0.886792 |
42 | BGC GAL NAG GAL SIA | 0.474074 | 0.962264 |
43 | BGC 18C GAL SIA NGA GAL | 0.46875 | 0.822581 |
44 | NAG GAL 5N6 | 0.457364 | 0.944444 |
45 | GAL SIA | 0.454545 | 0.90566 |
46 | SIA SIA | 0.446429 | 0.980769 |
47 | SLB SIA SIA SIA | 0.442478 | 0.980769 |
48 | SLB SIA SIA | 0.442478 | 0.980769 |
49 | SLB SIA SIA SIA SIA | 0.442478 | 0.980769 |
50 | SIA SIA SIA SIA SIA SIA SIA | 0.442478 | 0.980769 |
51 | CEQ BGC NGA GAL SIA SIA | 0.440789 | 0.784615 |
52 | MNA | 0.425743 | 0.867925 |
53 | SIA SIA SIA | 0.423729 | 0.980769 |
54 | NAG SIA | 0.40678 | 0.892857 |
No: | Ligand | Similarity coefficient |
---|
No: | Ligand | Similarity coefficient |
---|
No: | Ligand | Similarity coefficient |
---|---|---|
1 | GLC GAL SIA | 0.8915 |
This union binding pocket(no: 1) in the query (biounit: 3rsj.bio4) has 10 residues | |||
---|---|---|---|
No: | Leader PDB | Ligand | Sequence Similarity |