Receptor
PDB id Resolution Class Description Source Keywords
5AKH 2.1 Å EC: 3.3.2.10 LIGAND COMPLEX STRUCTURE OF SOLUBLE EPOXIDE HYDROLASE HOMO SAPIENS HYDROLASE
Ref.: SUCCESSFUL GENERATION OF STRUCTURAL INFORMATION FOR FRAGMENT-BASED DRUG DISCOVERY. DRUG DISCOV TODAY V. 20 1104 2015
Ligand
Ligand Chain:Residue Validity Ligand Warnings Binding Data NGL Viewer Molecular Weight (Da) Formula SMILES
DMS A:1551;
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78.133 C2 H6 O S CS(=O...
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96.063 O4 S [O-]S...
6NM A:1552;
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ic50 = 0.256 uM
289.255 C15 H10 F3 N3 c1cc(...
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90% Homology Family
Leader
PDB id Resolution Class Description Source Keywords
5AM1 2.15 Å EC: 3.3.2.10 LIGAND COMPLEX STRUCTURE OF SOLUBLE EPOXIDE HYDROLASE HOMO SAPIENS HYDROLASE
Ref.: SUCCESSFUL GENERATION OF STRUCTURAL INFORMATION FOR FRAGMENT-BASED DRUG DISCOVERY. DRUG DISCOV TODAY V. 20 1104 2015
Members (71)
No: PDB id Binding Data Representative ligand Formula Smiles
The Class containing this family consists of a total of 3 families.
1 3WKA ic50 = 29 uM S0G C10 H16 N4 O2 CN1C(=C(C(....
2 5ALW ic50 = 7.05 uM JQN C17 H15 N O2 S Cc1ccc(cc1....
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4 3WKD ic50 = 171 uM S0K C15 H16 N2 O2 S c1ccc(c(c1....
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6 5AK5 ic50 = 0.086 uM V2Z C12 H13 N3 O CCCC1=NC(=....
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12 3WK8 ic50 = 49 uM S0E C8 H5 F3 N2 S c1cc2c(cc1....
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17 5ALV ic50 = 43.48 uM 6TZ C9 H7 F N2 c1cc(cc(c1....
18 3WK9 ic50 = 70 uM S0F C10 H9 Br N2 S c1cc(ccc1C....
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22 5ALY ic50 = 0.1845 uM B7H C15 H13 F N4 O Cc1c(n[nH]....
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24 3I1Y ic50 = 7 nM 33N C21 H20 N2 O c1ccc(cc1)....
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31 4Y2Y ic50 = 9 uM 49Z C14 H16 F N S Cc1ccc(s1)....
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34 5ALT ic50 = 13.1 uM 9XZ C11 H10 N6 S Cn1nc(nn1)....
35 4Y2V ic50 = 91 uM 4A5 C8 H9 Br N2 O2 c1c(c(nn1C....
36 5AI8 ic50 = 125.6 uM K2T C8 H8 N2 S Cc1ccc2c(c....
37 5AI4 ic50 = 331.7 uM 4VY C8 H11 Br N2 O CN(CCO)c1c....
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39 5AKI ic50 = 0.754 uM 6NF C15 H20 N4 c1cnccc1c2....
40 5AK4 ic50 = 59.2 uM GVG C10 H10 N2 Cc1c(c[nH]....
41 5ALL ic50 = 2.678 uM II6 C9 H19 N O C[C@@H]1C[....
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43 5AKX - 8NY C7 H5 I N2 c1cc2c(cc1....
44 5AI0 ic50 = 206.4 uM JF6 C8 H7 N3 O c1ccc(cc1)....
45 5ALN ic50 = 0.267 uM 5ZM C16 H14 F N O CC1(c2cc(c....
46 5ALZ ic50 = 0.006 uM XQ9 C17 H29 N3 O3 S CS(=O)(=O)....
47 5AKE ic50 = 0.015 uM 6N0 C18 H16 F2 N2 O3 S c1ccc2c(c1....
48 1ZD3 ic50 > 500 uM NC4 C11 H20 N2 O3 C1CCC(CC1)....
49 5AI9 ic50 = 0.244 uM K78 C20 H26 Br N O CC(C)(C)c1....
50 5ALK ic50 = 0.252 uM WMR C15 H22 N4 S CCCCc1c2c(....
51 4Y2T ic50 = 150 uM 49Q C16 H18 O2 c1ccc(cc1)....
52 5ALE ic50 = 1.132 uM ONR C9 H6 Cl N O2 c1cc(c(cc1....
53 5AM0 ic50 = 1.32 uM LWS C15 H15 F N2 O CC1(c2cc(c....
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70% Homology Family (71)
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The Class containing this family consists of a total of 3 families.
1 3WKA ic50 = 29 uM S0G C10 H16 N4 O2 CN1C(=C(C(....
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50% Homology Family (80)
No: PDB id Binding Data Representative ligand Formula Smiles
The Class containing this family consists of a total of 1 families.
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50 5ALK ic50 = 0.252 uM WMR C15 H22 N4 S CCCCc1c2c(....
51 4Y2T ic50 = 150 uM 49Q C16 H18 O2 c1ccc(cc1)....
52 5ALE ic50 = 1.132 uM ONR C9 H6 Cl N O2 c1cc(c(cc1....
53 5AM0 ic50 = 1.32 uM LWS C15 H15 F N2 O CC1(c2cc(c....
54 5AM4 ic50 = 0.113 uM MVJ C18 H23 N O2 c1cc2c(cc1....
55 4Y2J ic50 = 800 uM 49G C13 H17 N3 Cn1ccc(n1)....
56 4Y2X ic50 = 0.51 uM 4A0 C19 H27 N O c1ccc(c(c1....
57 5AM1 ic50 = 0.003 uM I5T C23 H24 N2 O3 c1ccc(cc1)....
58 5AK6 ic50 = 362.4 uM YPN C7 H8 Cl N O S c1cc(ncc1C....
59 5AI5 ic50 = 0.093 uM BSU C13 H12 N2 O c1ccc(cc1)....
60 3WK4 ic50 = 7.4 uM S0A C12 H16 N2 O C[C@H](C1C....
61 3WKC ic50 = 195 uM S0J C14 H19 N3 O S Cc1cc(c(n1....
62 5AKL ic50 < 0.086 uM 6N8 C20 H20 N2 O c1ccc(cc1)....
63 5ALD ic50 = 1.08 uM FCW C14 H17 N O c1cc2c(cc1....
64 5AKY - 6NJ C15 H14 N2 c1ccc(cc1)....
65 5ALU ic50 = 0.022 uM HD2 C24 H34 N4 O3 c1c(c(nc(n....
66 5ALF ic50 = 0.204 uM OE1 C19 H23 N3 O2 S CCCN(CCC)S....
67 3WKB ic50 = 61 uM S0I C15 H14 N2 O c1ccc(cc1)....
68 4Y2R - 49O C10 H12 N4 c1cc(c(nc1....
69 3WK7 ic50 = 127 uM S0D C11 H10 N4 Cn1cc(cn1)....
70 5ALM ic50 = 0.294 uM 7GM C16 H23 N O S C[C@]1(CCN....
71 5AI6 ic50 = 40.19 uM 4XH C9 H6 Br N c1cc2c(ccc....
72 3ANT ic50 = 8.5 nM S82 C20 H26 N4 O2 CC(C)c1nc(....
73 4JNC ic50 = 3 nM 1LF C19 H23 F3 N6 O Cc1nc(nc(n....
74 6FR2 ic50 = 4.99 nM E3N C21 H30 F3 N3 O5 S CC(C)S(=O)....
75 4X6X ic50 = 2.3 nM S74 C30 H32 N2 O4 c1ccc(cc1)....
76 4X6Y - S94 C21 H24 N2 O2 c1ccc(cc1)....
77 3ANS ic50 = 565 nM S38 C17 H14 N2 O c1ccc(cc1)....
78 4O08 - PO6 C8 H9 N O2 c1ccc(cc1)....
79 2CJP Ki = 0.8 mM VPR C8 H17 N O CCCC(CCC)C....
80 5NG7 - SER C3 H7 N O3 C([C@@H](C....
Polypharmacology
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Ligand no: 1; Ligand: 6NM; Similar ligands found: 1
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1 6NM 1 1
Similar Binding Sites (Proteins are less than 50% similar to leader)
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This union binding pocket(no: 1) in the query (biounit: 5am1.bio1) has 47 residues
No: Leader PDB Ligand Sequence Similarity
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